Valiossa sovelletaan koko henkilöstöä koskevaa bonuspalkkiojärjestelmää. Niin sanottu ohjaava palkitseminen tarkoittaa Valion kokonaistuloksen ja eri toimintojen omien saavutettujen tavoitteiden perusteella maksettavaa bonusta. Tuloksen toteutumisen perusteella maksettu vuoden 2010 bonus oli 4,0 miljoonaa euroa.
Vuosittain määritellyn budjetin puitteissa toimipaikoilla on mahdollisuus tukea harrastuskerhojen toimintaa.
Työntekijöitä palkitaan pitkästä urasta Valiossa. Kymmenen vuoden välein henkilö saa palkkion, jonka suuruus kasvaa sen mukaan, mitä pitempi ura on takana.